Pengelolaan kependidikan MIQT dipimpin oleh seorang Kaprodi bergelar Guru Besar dan memiliki reputasi nasional maupun internasional di bidang Studi Islam. Dalam menjalankan tugasnya, keprodi dibantu seorang Sekprodi bergelar doktor. Demi menjamin kelancaran dalam proses belajar dan mengajar di MIQT, para dosen bersikap pro-aktif. Dari 9 dosen tetap tersebut, antaranya 1 bergelar Guru Besar (Professor), 2 bergelar lektor kepala (doktor), dan 6 lainnya bergelar Lektor (Doktor)
| No | Nama Lengkap DTPS | NIDN/NIDK | Jabatan Fungsional |
|---|---|---|---|
| 1 | Prof. Dr. Waston, M.Hum | 623076001 | Guru Besar |
| Dr. Andri Nirwana. AN, Ph.D | 2101068301 | Lektor Kepala | |
| Drs. Syamsul Hidayat, M.Ag | 605096402 | Lektor Kepala | |
| Dr. Muthoifin, S.H.I., M.Ag | 0606098001 | Lektor | |
| Dr. Hakimuddin Salim, Lc, MA | Lektor | ||
| Dr. Kharis Nugroho, Lc., M.Ud. | 0616048501 | Lektor | |
| Dr. Ainur Rha'in, S.Th.I, M.Th.I | 0603078402 | Lektor | |
| Dr. Mutohharun Jinan, M.Ag. | 0602037301 | Lektor |